最早投靠后金的是科尔沁部，科尔沁诸部的首领尽管也是姓孛儿只斤（或称博尔济吉特、博尔吉锦）的，但却并非“黄金家族”成员，其祖先是成吉思汗的弟弟合撒儿。有意思的是，不管是谁强大，科尔沁部都是最先投靠的，达延汗时期，东蒙古所有部落的首领均是“黄金家族”成员，唯有科尔沁不是，就是因为他们最先投靠达延汗并且紧紧追随。或许，这也是一种生存方式和生存哲学，不过，仅仅适用于弱小的群体，如果一个民族和国家是非常强大的，或者有机会变得非常强大的话，千万别学科尔沁，因为你至少有机会变得强大，所以即使投降了，别人也不会放过你的。

　　努尔哈赤在古勒山击败了九部联军以后，威名大振，科尔沁心里就痒痒了，尽管才跟努尔哈赤干过仗，但还是遣使向建州女真要求通好。努尔哈赤并非有仇不报之人，只是他不想树敌太多，需要拉拢一帮人，在蒙古同样需要一个同盟，而且不是一个普通的盟友，他要的是钢铁同盟。最好的办法就是联姻，你中有我、我中有你，这样才能不分彼此，努尔哈赤时代，后金和科尔沁各部的高层联姻十次，总体以建州女真单方面娶入为主，皇太极时代，共联姻十八次，嫁娶大体各半，清朝前期四帝的四后、十三妃均出自科尔沁，当中最有名的就是后来的孝庄皇太后。终清一世，科尔沁从无反复，一直紧紧地追随清朝政权，成为了清朝在蒙古诸部中最为信赖的钢铁同盟。

　　内喀尔喀五部归降也比较早，努尔哈赤在蒙古问题上做得还是相当不错的。不遗余力地拉拢内喀尔喀，给钱、给物、给奴隶、给女儿、给侄女，后金建立以后，内喀尔喀陆续归服，至努尔哈赤死前，内喀尔喀基本臣服。但是，由于另外一个人的存在，使得这个联盟仍然存在反复——察哈尔部的林丹汗。
　　十七世纪初，林丹汗继任全蒙大汗，统领着察哈尔等部，是漠南蒙古最强的部落，也是全蒙的强部，他一心想要恢复昔日强盛的蒙古帝国，在很长一段时间内，迫使内喀尔喀臣服，其余的蒙古部落也对其保持了基本的君臣之礼。在后金建立以前，曾一度压制住了努尔哈赤，阻止了建州女真的西进，在辽东局部地区形成了：明朝、后金、蒙古，三方鼎足的态势，大体上是明、蒙联合对付后金。不过由于明—蒙联合本身就有很大的不稳定性，加之又以经济为媒介，后金建立以后在辽东攻城略地时，林丹汗并没有太大的作为，甚至时不时趁着明清交火之际对明朝趁火打劫一番。

　　在后金和熊廷弼对峙的时候，努尔哈赤尽力争取蒙古，内喀尔喀和后金盟誓联合。林丹汗着急，立刻致书努尔哈赤：“蒙古国统四十万众英主青吉思汗，谕问水滨三万人英主安否？……”当中的“四十万人主”是林丹汗自称，“三万人主”指的是努尔哈赤，这种称呼倒也并非毫无根据，明代的蒙古人称呼一个民族，一般都会把大概的人数带出来的，比如“八十万汉人”、“二十六万土伯特（藏族）”、“三万高丽”等，还有就是刚才说的“四十万蒙古”、“三万女真”，这倒也没什么，只是这个概数概得太离谱了。此时蒙古人和女真人之间的差距哪里有这么大，此信完全是林丹汗用察哈尔的军队威胁努尔哈赤，揭了女真人曾经臣服蒙古人的老底，努尔哈赤也不客气，揭了元朝被推翻，又被明朝军队驱赶狼狈逃窜的老底，反正双方是谈不拢。

　　以后后金下辽阳、攻广宁，明廷需要林丹汗的迫切性也越来越大，给他的钱也越来越多，但是林丹汗畏于后金兵锋，并未出兵。努尔哈赤渐渐扩大在蒙古的势力，但凡跟察哈尔有矛盾的蒙古部落一律拉拢，林丹汗若是出兵攻打该部落，努尔哈赤就出兵帮助，迫使察哈尔退兵，但是终天命一朝，后金并未大规模跟察哈尔交火。
　　努尔哈赤在蒙古问题上的认识还是很成熟的，尽管“黄金家族”在蒙古草原上的地位几经变更，但大体上还是保持了很高的威信，全蒙的大汗更是由成吉思汗的直系子孙担任。汗位传至林丹汗，尽管他的才干并不十分出众，但后金如果冒冒然出兵察哈尔的话，会引起全蒙的敌对和仇视，这对日后执行臣服蒙古各部的战略大大不利。所以努尔哈赤只有分化打击，逐渐拉拢各部，等待时机。

　　日期：2012-10-14 10:30:22
　　皇太极登基后，继续执行这一策略，他深知，若要统一漠南蒙古，进而控制全蒙，林丹汗的存在是一个巨大的障碍。天聪元年（1627年），察哈尔的重要部落奈曼、敖汉在皇太极的恩威并施下决定归附，皇太极异常高兴，给予其很高的礼遇，次年二月又袭击了多罗特部，此事前文提过，林丹汗逐步陷于孤立的境地。当时的林丹汗四处出兵掠夺蒙古各部，或者强迫对方交出财物，企图统一全蒙，这引起了蒙古各部的不满，喀喇沁等部组成多部联军和察哈尔开战，双方都遭到了巨大的创伤，喀喇沁遂致书皇太极，请求他的帮助。

　　林丹汗的势力越来越小，越来越多的蒙古部落归服皇太极，并请求后金出兵攻打林丹汗。皇太极在蒙古各部中的盟主地位逐渐确立，在这种情况下，出兵征讨察哈尔的时机已经成熟，遂决计出兵。
　　天聪二年（崇祯元年，1628年）九月初六，后金大军开拔。同时，皇太极第一次以蒙古“盟主”的身份下令已投靠后金的蒙古各部派军，协助后金军队征讨察哈尔。十九日，满蒙军队已经完成了会盟，也已经接近了察哈尔大军，遂一夜疾行，次日早晨突然袭击了察哈尔的四部军队，大获全胜，招降纳叛，杀死拒不投降者。然后马不停蹄地继续追剿察哈尔退兵，一直追击到大兴安岭才返回，随后大封蒙古诸贝勒。十月十五日，后金大军返抵沈阳。

　　此战打掉了林丹汗在漠南蒙古居于统治的地位，初步解除了后金后方来自察哈尔的军事威胁，其余蒙古各部相继臣服，在后金统一蒙古的道路上又前进了一步。同时，蒙古各部的臣服使得后金又增添了一份力量，在明清双方对峙的胜利天平上又加了一颗砝码，日后后金但凡是大规模出征，蒙古各部均出兵相助。而招降和内附的蒙古民众又被安排进了八旗大军，其实之前八旗军中也有蒙古人，只是零星地存在于各旗之中，此战过后，在后金治下的蒙古人激增，遂独立成旗，以后渐渐扩充为八旗，蒙古八旗的建立实始于此战。

　　日期：2012-10-15 19:10:52
　　第三节破关南下
　　皇太极知道以此时后金的实力根本无法突破关宁锦防线，但是伐明之事不能继续僵持下去，由于后金后方的三股势力：毛文龙、朝鲜、蒙古，都发生了较大的变化，所以皇太极决定不再走原来的进军路线，而是绕开辽西走廊，取道蒙古，走长城的其他入口，直接入关，目标直指明朝都城——北京。既然短时间内无法按部就班，一步步杀进来，那就干脆绕开明朝的重重城关，直接袭取京城，撬动明朝的统治根基，这样一来，周围的明军就会失去心理依托，然后望风而降，后金攻取山海关、进军华北的梦想也会得以实现。

　　天聪三年（崇祯二年，1629年）十月初二，皇太极统领八旗大军开拔，留二贝勒阿敏镇守沈阳，其余贝勒多从军伐明，又以盟主的身份诏令蒙古各部会师，协助满洲军队，为其带路。仅十五日一天，就有23位蒙古贝勒领兵顺利会师，所以此次后金及蒙古盟军的总人数大约在8万—10万之间。由于当年正是农历的己巳年，所以这场战争又称“己巳之变”。