日期：2021-03-26 08:05:16
　　清军分兵迎战。经过一整天激战，清军略占上风，但双方均伤亡较重。由于未能将吴军彻底击退，战况暂时转为对峙。
　　在这种情况下，双方谁先得到增援，谁就占据主动。激战之后，贝勒洞鄂赶紧差人向张勇和孙思克求援。这时，甘肃总兵孙思克刚在甘州击退黄番部落入侵，已率部渡过黄河，与张勇会师，正欲兵围巩昌叛军。接到洞鄂的求援信后，张勇围巩昌，孙思克即率两千绿旗兵赶往秦州。
　　途中经过大片麦田，麦苗已然反青，正茁壮成长，孙思克传令：勿踏青苗，违令者斩！于是部队绕过麦田，继续行军。抵达秦州后，在城西边扎营。
　　据守秦州城的王辅臣部将陈万策等，由于城内物资匮乏，苦不堪言，本来就已惊惶不安，见清军援兵到来，更是陷入绝望之中。陈万策见部下士气低落，毫无战意，只好差人向清军投降。洞鄂见报，喜出望外，马上应允。
　　于是，陈万策在五月底率秦州兵民出降，原秦州知州巴三刚逃走。清军围城一个多月，终于收复了秦州。
　　日期：2021-03-26 09:04:38
　　被清军阻隔在秦州外围的四川、平凉等地叛军，只好撤兵逃走了。洞鄂即遣振武将军佛尼勒、总兵孙思克等，追剿叛军。几经交战，清军一举收复了秦州附近的礼县、清水、伏羌（甘谷县）、西和等县城。
　　清军围困秦州的同时，也向巩昌、兰州的叛军发起进攻。张勇自率一军攻打巩昌甚急。王辅臣以巩昌其地关系重要，急派副将任国治等领兵三千，由巩昌东门潜入城内援守。守城的叛军总兵陈科、郑远经等得到增援，即率军六千，分四门而出，直冲清营。
　　此时已年近六十岁的张勇因患有脚疾，不能骑马，他站在马车上指挥迎敌。一时间城上城下炮声隆隆，双方死伤颇重。清军的人数虽少于叛军，但在甘肃提督的亲自督战下，士气倍增，叛军抵挡不住，被迫逃回。清军游击张大选追至城下，中炮而死。此役，共俘虏叛军近五百人。
　　日期：2021-03-26 10:01:14

　　六月二十五日，前锋统领穆占、总兵孙思克率兵抵达巩昌增援，清兵云集城下，施以招抚之策。派遣已投降的秦州守将陈万策等人，入城宣示圣祖的赦免诏书。叛军总兵陈科等接受招抚，率众出降，计马步兵五千、民兵五千余人，安插居民十三万五千多人。至此，巩昌收复。
　　此时，西宁总兵王进宝已率部于四月初用革囊结筏渡过黄河，包围了兰州。兰州向为河西五郡咽喉之地，叛军拼命死守。一个月来，清军连营环攻，屡次将冲围的叛军打回城内。由于兰州城池坚固，清军一时半会尚难以攻下。副将万祥建议先取兰州右翼的临洮，以绝叛军之援，王进宝同意。
　　王进宝留部分兵围兰州，自己亲率部冒着大雪，向临洮疾进，途中有很多兵士因犯困而慢行，王进宝挥鞭大呼：“到临洮有肉吃，拖延只会冻死！”于是士卒皆奋勇行军，于半夜抵达临洮城下。万祥见城墙上有个大缺口，便带兵从此处悄悄登城。刚登上数十人，被守城兵惊觉，忙射箭扔石抵抗。万祥大呼：“今欲退无路，唯有猛进！”亲手斩杀数名叛军，后面清军陆续登城，终于将临洮城攻下。

　　日期：2021-03-26 10:44:29
　　王进宝率兵整整围困了兰州城两个多月，城内粮食将尽。叛军造木筏百余只，企图渡黄河逃跑。王进宝在城外黄河沿岸设置伏兵，击退逃兵，城内叛军已无力反击。王进宝与甘肃按察使伊图乘机差官到城下，宣谕朝廷的招抚政策，许诺如投降即赦免一切过犯。叛军走投无路，被迫放弃抵抗。六月二十七日，叛军总兵赵士升及原任布政使成额，率城中文武各官和兵士五千余人献城投降。
　　这时，陕北叛军攻打榆林三月不下，转而东趋神木。叛将朱龙暗中窜通守神木的副将孙崇雅，乘夜开城门将叛军放入，神木兵备道杨三知、知县孙世誉、守备张光斗等，在抵抗中皆遇难。于是叛军占据了神木，势力膨胀。
　　日期：2021-03-26 11:12:21
　　许占魁遣其子许登隆奔赴北京告急。圣祖诏授许登隆为鸿胪寺少卿，派将军毕力克图、都统觉和托自大同移师赴援，陕西总督哈占派遣参将杨宗道会剿。许占魁派副将孙维统、游击钱应龙等跟从觉和托攻击叛军，因擒斩太多没法计算。
　　叛将朱龙向西窜逃至宁夏和陕北交界的定边，被赶来会剿的陕西提督陈福斩杀。
　　清军乘胜收复鱼河、响水、波罗诸堡，擒获叛将刘尚勇等，皆斩之。六月底又陆续收复绥德、延安等地。
　　许占魁等督师围攻神木，神木军民绑缚叛将孙崇雅以献。土寇周济民死于乱军中，余党皆伏诛。张国彦、杨三知等殉职文武将官都受到朝廷赐恤。

　　日期：2021-03-26 12:00:42
　　圣祖督促西北各路清军围剿叛军的同时，仍不放弃对王辅臣的招抚。他抓住王辅臣畏罪不敢降的心里，在七月又给他发去一道安抚的敕谕。
　　数日后，王辅臣回奏圣祖，仍然口称“皇上”，表现的很恭敬。表明他原则上愿意接受招抚，但又心怀疑虑，托词说众将有顾虑。圣祖怀疑他借口推诿，希冀缓兵，督令张勇、洞鄂诸将，从速攻取平凉。同时，尽快攻破固原，以便夹攻平凉。
　　本来清军已在陕甘取得重大进展，攻取平凉，灭王辅臣也指日可待。不料，情况又突起变化：兴安游击王可成等复叛，王可成部与四川叛军会合，攻陷旧县关（柞水县），将逼西安。南山群寇又分别兵出各要口，形势急转直下。
　　日期：2021-03-26 12:32:22
　　圣祖很生气，下诏严责陕西总督哈占及诸将领，说：“王辅臣初叛时，朕以兰州要地，关系三边，令哈占发兵镇守。哈占称：西安要地，不便分兵，致使兰州诸地沦陷，三边摇动。哈占又以西安重要，屡次请援兵，因而把荆州大军陆续调至西安，致使荆州、彝陵兵力单薄。哈占为封疆大臣，每当议事，不从全局一体筹划，但只顾自己所在之地，今又称叛军与川寇联合，想让诸将率部都开赴西安。哈占但知有西安，竟置他处于度外！”

　　圣祖严厉批驳哈占后，命令诸将当应急攻平凉，勿得稍缓。为保证攻取平凉，圣祖还令驻守榆林的土默特、鄂尔多斯蒙古兵速赴西安。
　　日期：2021-03-26 13:13:54
　　这时，王辅臣给洞鄂　 ，称：他曾派官员王起凤赴西安，谈判投降，已过两月，不见回来，因此士卒都很疑惧不敢降。洞鄂为王辅臣向圣祖请命，希望派有威望的大臣前往招降。圣祖批评洞鄂说：“王辅臣的目的，是诱我缓师，诸将不要中计。”圣祖要求诸将速行围城，务期剿灭。至于王起凤，可以遣还平凉。
　　洞鄂等率大军进抵平凉，既没有围城，也没有进攻，而是离城远驻，静观形势。王辅臣见状，并未过于惊慌，相反，还派出部分军队分别增援固原、庆阳等处叛军。特别是庆阳叛军本已受招抚，却又被王辅臣派去的周养民率部包围，重新夺回来。
　　清军向平凉地区集结的消息，使吴三桂颇为着急，他调遣云贵少数民族士兵万余人到平凉援助王辅臣。还命令四川叛军应援平凉。于是，吴将王屏藩又率川军进犯秦州，吴之茂、谭弘也以所部向平凉增援。兴安叛军也进犯商州大峪口。
　　日期：2021-03-26 13:53:42
　　本来对清军很有利的形势，又陷入被动局面。正如圣祖所分析，就因为王辅臣未灭，清军都集中在平凉，故其他叛军乘隙发动进攻，欲分清兵力，以援王辅臣。

　　圣祖在敕谕里质问洞鄂：“你们拥大军于平凉，所司何事？现在不攻取，更待何日？”圣祖又下令催促：“赶快策划，速取平凉，剿除逆贼！”
　　偏在这时，参赞海尔图又节外生枝，声称：运炮的屯夫都逃跑了，请求从京师调发熟悉火炮的满汉军前来平凉。洞鄂据此向圣祖汇报。圣祖不胜恼怒，下旨斥责：“洞鄂对此事不置可否，只知道照转他人请求，拖延时日！”圣祖下令解除海尔图参赞的军职，令洞鄂仍遵前旨，速攻平凉。
　　九月中，陕西提督陈福率部自灵州（灵武）南下进攻固原。王辅臣遣部将来援，固原城守军也出城迎战。
　　双方刚一接战，不料清军副将贾从哲、游击张元经忽然临阵退缩，使清军受到惊扰，战斗失利，副将泰必图因此而战死。提督陈福将战役经过据实上奏。

　　圣祖阅览战报，提笔批示，将贾、张两人就地斩首，以示三军。
　　圣祖指示清军将帅，或先攻取固原，或会合大军取平凉，视具体情况而定。但是，由于贝勒洞鄂等一直拿不出切实可行之策，致使攻取平凉迟迟看不到希望。
　　日期：2021-03-26 14:59:08
　　视线再回到浙江。曾养性得到耿军兵围衢州失败的消息后，决意先攻下台州，再分兵攻打衢州、金华。他率领祖弘勋、阿尔泰等进至台州府城南郊，分三营驻扎，连绵数十里，曾养性居中，祖弘勋居左，阿尔泰居右。