到帝俊时期，魔怪已然势力强大，天下大乱，天帝见情势危急，命天庭的大神们倾巢出动，到世间帮助人类祛恶除暴，天帝自己也和混元魔女打了几仗，一时难分高下。神、人和魔怪的战争进行了数百年，神魔死伤无数，天下生灵涂炭，人间万物萧条，世界一遍狼藉。
　　混元魔女恶行累累，坏事做得得心应手，风生水起，力量更加强大，逐渐占据了上风。她使出奸计，让九头鸟鬼车引开天帝，自己偷偷溜到月亮们居住的溪谷，先一口吞下柳月，又化作她的模样，欺骗其她十一个月亮，使出幻魔术，让她们和自己一起变成玉兔，在天空里玩耍。十个太阳本来就贪玩无脑，这时候看见空中出现十二只活泼乱跳的兔子，禁不住口水直流，张开金色的翅膀冲上天空，向着兔子们追去，人世间顿时如同炼狱，到处燃烧爆炸起来。金乌们各自追着一只兔子，张开大口把她们吃掉，全然不知吃的却是自己的妹妹，其实也没有什么，洪荒时代还没有亲情伦理。只有桂月幸免于难，躲回了溪谷。

　　此时在地上，受天帝之命下界驱魔除怪的天神羿见情势危急，张弓搭箭，射下九个太阳，只留下赤日，消泯了创世以来的第一次弥天浩劫。
　　日期：2015-08-04 08:24:10
　　混元魔女这时现出原形，想把赤日杀死，让世间永远失去光明，以毁灭整个世界。羿连发十八箭，射退混元魔女，在混元魔女和赤日之间布下了连排箭云，赤日连滚带爬逃回东海，一头扎进灌木丛中不敢出来。此后为纪念死去的兄弟姐妹，剩下的太阳赤日和月亮桂月每过几年，便会一起在天空祭奠，寄托哀思，反省过去，天地也会短暂地陷入黑暗之中。这便是上古时期后羿射日、天狗食月的由来。

　　天帝斩杀了鬼车，回来后发现儿女们都已遇难，盛怒不已，他封闭了羿的灵窍，剥夺了他飞行的神力，永不许他再返天庭。天帝怕剩下的两个儿女赤日、桂月再有危险，就把他们的元神从太阳、月亮中分离出来，和他们的母亲羲和、常義一起都称为太阳神、月亮神，住在太阳宫、太阴宫里，而太阳和月亮就由双翼飞马牵引，载于金色和银色的两轮车里，分昼夜轮流到天空逡巡，把光和能量带给人类及万物。

　　此后天帝立誓要消灭混元魔女，他在大荒山找到了混元魔女，两人激战十天十夜，天帝抵敌不住，身受重伤，幸好这时元始天尊匆匆赶来，经过一番艰难鏖战，赶走了混元魔女。
　　元始天尊深知自己的力量将会随着元神的涣散而消失，而混元魔女因为成功地在人类心中播下贪欲邪恶魔念，为己所用，魔灵不断滋生，力量日渐增长，终有一天会被她得逞。于是他和灵宝、道德二天尊商议，决心重新构建宇宙新秩序。三尊三位一体，用剩余的创世神力构建了天囿，闭关锁天，把大地、天空和天庭包裹起来，从此混元魔女再也无法进来搞破坏了。世间魔怪没有了混元魔女的领导，也很快被各路大神和人类消灭殆尽。

　　天帝因为受伤严重，不久就元神灭散，灵窍出体，和那些战死的神祇一样，无所依附，四处飘荡，那些被杀死的魔怪的魔灵也到处哀嚎，骚扰人神。灵窍和魔灵都惧怕寒冷，却又趋附寒冷，三天尊于是开辟出宇宙中最寒冷最黑暗的北冥天，让灵窍和魔灵渐渐堕入其中，被永久封冻起来。
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　　地上经此浩劫，人口数量锐减，而且混元魔女播下的贪欲恶念也驻留人类心中，挥之不去。天地之间的原始精气也越来越少，神和人的生命都受到威胁，三天尊的神力也丧失殆尽，为了维持宇宙的正常运行，他们决定建立一套良好的体制来管理这个世界。
　　于是人的生命被让渡给神，道德天尊在人类心灵里播下信仰的种子，他们逐渐开始崇拜神，供奉神，并把自己吸纳的精气奉献给自己供奉的神，成为他们的神气，延续神的生命，以保证他们永生不灭，维持对这个世界的持续控制。人类的元神会随着供奉越来越少，吸纳精气的能力也越来越弱，身体也开始逐渐老去。为避免他们元神涣散，灵宝天尊在神的维度里划出冥界，建筑冥刹，命十殿阎罗掌控，人类的最后一点元神会转化成灵魂，被接到冥界统一管理。此后人就会死去，力量消失，肉体腐烂，成为其它生命的食物来源。但这样一来，人类很快就会完全消亡，灵宝天尊便赋予人类与万兽万物繁衍后代的能力，从此女娲以黄土抟造的人类也可以通过男女交合，氤氲化育，孕育生出自己的后代了。

　　人类的生存期限虽然大大缩短，但他们的灵魂到达神的维度后，会接受审判，有贪欲邪恶而作奸犯科的，便会根据罪行轻重在十八层地狱受刑赎罪，祛除魔灵，无罪的则经过奈何桥重回世间轮回，实质上仍可达到永生的目的，所以在神看来应该是个双赢的结局。此后人类生活的地方就被称为了凡间或下界，神的维度则称天庭、上界以及阴间或冥界。冥界是人永恒的归宿，世间轮回只是你的美妙假期，这句话道出了阴阳界的本质，所以人更留恋在世间的日子。

　　在完成这些神秘复杂的架构后，人类具有了伦理观念和道德信仰，更容易组织起来发挥团体的力量。由于创世大神们纷纷元神涣散，重归天地，对大地的改造和管理自然就落到了人类身上。人类不再能长生不死，有了生存的压力和延续自己血脉的强烈愿望，从此必须勤奋劳作才能生存发展，必须殚精竭虑才会免遭苦难，必须群体合作才能更加强大，必须积累知识才有更大进步，人类的力量日趋强大，对自然的改造不再是神的专利。

　　元始天尊乐意看到这样的结果，因为仅凭神的力量，无法更精细地改造、完善及管理整个世界。为了统御各方力量，建立正常秩序，三天尊及众神在总结以前思考和现实实践的基础上，建立了金字塔式的神权体系，成立了三界十方、四生六道最高政权。元始天尊被推举为这个体系的最高管理者，但这时因为神力丧失，他也面临元神涣散的境地，于是他将元神化身为婴孩，由灵宝天尊送至光严妙乐国，托梦与国王净德时王的老婆宝月光王后，诞生后成为光严妙乐国的太子，长大后他继承王位，勤政爱民，行善救贫，但不久就舍国去普明香严山中修道，功成超度，飞升天庭，即玉皇大帝位，受万神万民敬仰。后灵宝天尊、道德天尊也下世渡劫，历劫飞仙，受万民敬仰，永生于天地之间。

　　玉皇大帝即位后，娶西王母为后，开始分封神职，连创世大神们都一并得到封赐，于是诸神各归其位，各司其职，建立起总管三界（天上、地下、空间），十方（四方、四维、上下），四生（胎生、卵生、湿生、化生），六道（天、人、魔、地狱、畜生、饿鬼）一切阴阳祸福的神权体系。
　　天道既成，诸神归位，世界进入了飞速发展的轨道，各种思潮和文化泛滥，推动人类文明取得不断进步，世界按照神的意志有序运行，生生死死，循环往复，吐故纳新，自我进化，一切都在道德与法理的约束中规范化运行。每当人类找不到方向，处于迷茫之时，灵宝天尊和道德天尊就下世度人，指点迷津，很多时候他们又被称为太上道祖和太上老君。玉皇大帝也在神和人的敬仰供奉中逐步稳固自己的地位，终于成为万神之王，诸天之主，宇宙至尊。而信仰则成为人类精神的桎梏和枷锁，只有强大自由的心灵才能突破。