铁木真成为全蒙古大汗后，首先任命博尔术的弟弟斡歌连与合赤温共同管理部落的弓营，又命汪古儿和合答安答勒掌管司膳，让迭该当起了牧羊人，迭该的弟弟古出沽儿负责修理武器车辆。同时，令朵歹管理宫中的妻女、子弟和仆人。
　　在军事上，铁木真任命合撒儿为总指挥，他的另一个弟弟别勒古台则负责管理军马， 阿儿孩合撒儿、塔该、速客该、察兀儿罕四人为通信联络官。铁木真让他们分别给脱斡邻勒和扎木合送去了自己被立为蒙古大汗的消息。最后，他对博尔术和者勒蔑两人说：“你们两个，在我除了影儿外别无友伴之时来做我的影子，在我除了尾巴没有别无鞭子之时，来做我的鞭子。你们使我心安，我也会我把你们铭记在心中！你们俩就做这些人的首长吧！”

　　脱斡邻勒汗的回复非常爽快，他说：“你们立我的儿子铁木真为汗真是太好了，你们蒙古人怎么可以没有汗呢？希望你们不要违反立汗的协议，不要别破坏盟约，那样等于撕破了自己的衣领！”
　　而扎木合得到的消息是以众贵族的名义和口吻发来的，他虽明知道这是铁木真有意为之，却也不能发作。只得将怨气发泄到四大贵族身上。他让信使带回口信说：你们这些旧贵族为何用戳腰刺肋之计离间我和铁木真安答？为什么当初我俩在一起时不立铁木真为汗，而今又怀何意立他做了汗？如今你们这些贵族要说话算话，让我安答放心，做我安答的好助手！

　　在铁木真的挑唆下，扎木合与众贵族的关系变得更加恶劣了，这样一来贵族们也只能诚心实意地拥护他了。但扎木合却把对铁木真的恨，暗暗地埋在了心里。
　　一天，札木合的弟弟绐察儿在札剌马山前的斡列该泉边居住时，抢劫了住在撒阿里草原的铁木真部属拙赤答儿马剌的马群。拙赤答儿马剌的同伴都因为畏惧扎木合的实力而不敢去追，拙赤答儿马剌骂道：“你们这些懦夫。”便独自一人去追。
　　拙赤答儿马剌顺着克鲁伦河上游跑了整整一天，在夜里才终于找到了丢失的马群。他伏在所骑马的马鬃上，悄悄地走近前去一箭将绐察儿射死了，并把自己的马群驱赶了回来。
　　扎木合听后大怒，当即联合泰亦赤兀、亦乞剌思、兀鲁吾、那也勤、八鲁剌思、霸邻等十三部，组成三万骑，越过阿剌兀惕山、土儿合兀惕山，前来攻打铁木真。当时，铁木真正在古连勒古山一带驻牧。亦乞列思氏人木勒客脱塔黑和孛罗剌歹二人前来告变。铁木真获此急报，立即组织了一万兵马，也分成十三个古列延，赶到答阑巴勒主惕之荒野迎战札木合。双方在今克鲁伦河上游支流巨赫尔河附近发生战争，战场里布满了沼泽，据说有七十个之多，这是铁木真第一次独自率领大规模军队作战，历史上称这场战役为“十三翼之战”，。由于双方实力悬殊，铁木真一开始便落入被动，只能且战且退，他自知完全没有赢下来的可能，心中所想的只是尽可能保存实力，将损失降到最低。最后，他退至斡难河的哲列捏山峡，扼险据守。

　　由于铁木真居高临下，扎木合一时也无计可施，心里非常愤懑。他在山峡下围守了7天，证明自己获得了完全的胜利，就此回撤。扎木合起初本想突袭铁木真，打他个措手不及，不料却被铁木真先获得了情报，有了防备。当他听说是自己本方的亦乞列思氏人告的密时，更加怒不可遏，在途中，扎木合用七十口大锅煮死了赤那思氏所有青壮年，并砍下首领捏兀歹?察合安兀阿的头，拖在马尾后面扬长而去。

　　扎木合的联军都是惟利是图的雇佣军，他们眼见扎木合这样对待盟友都非常不满，“十三翼之战”表面上虽然是扎木合大获全胜，却也暴露了他横虐的性格，这使得盟友们都开始因厌恶札木合而疏远扎阑部，进而纷纷投靠渊停岳峙的铁木真。铁木真虽在军事上惨败，但在政治上却获得了草原人们的好感。
　　日期：2013-10-13 16:37:16
　　扎木合刚刚撤退，他的阵营中便开始有蠢蠢反意。兀鲁兀惕氏人主儿扯歹率领他的兀鲁兀惕人，忙忽惕氏人忽余勒答儿率领他的忙忽惕人，率先投奔了过来。这两个部落乃是扎木合联盟中最强悍的，他们的倒戈让铁木真的力量大大增强，使两个部落已形成了分庭抗立的对峙局面。另外，幌豁坛氏首领蒙力克，也就是被铁木真称做父亲的人，起初并没有随铁木真迁徙，而是留在扎木合的帐中，现在也终于辩明是非，转投到了铁木真帐下。

　　即便与蒙力克有着特殊的关系，铁木真并没有因为此人曾经的背叛而气恼，在他身上有着残酷的草原人所缺少的宽容和大度。见从札木合处有这么多百姓来投奔自己，铁木真很高兴，他下令在斡难河的树林里举行宴会庆贺。但是在这次宴会上却发生了一段不和谐的插曲。事情是这样的，别勒古台在宴会附近抓住了一个偷马贼，那人是合答斤氏人。但主儿勤氏的不里孛阔却袒护那个人，别勒古台与他发生冲突，在搏斗的过程中，不里孛阔砍伤了别勒古台的肩膀。坐在树阴下的铁木真目睹了这一切，他问别勒古台：“为什么被伤害成这个样子？”

　　别勒古台诉说了事情的原委，并说：“现在我们的部落刚刚相熟，不要为了我造成和主儿勤氏之间的失和。我不要紧的，哥哥不要追查下去了。”
　　铁木真不听他的劝告，用捣马奶的木杵打伤了不里孛阔，接着又将主儿勤氏的另两个人豁里真合屯和忽兀儿臣合屯绑了起来，原因是他们扰乱宴会秩序。豁里真合屯和忽兀儿臣合屯在酒席上因为倒酒的司膳先为铁木真斟酒之后才他们倒酒而大为不悦。主儿勤氏部被称为蒙古诸部中最勇猛的部落，他们是合不剌汗的长子斡勤的后嗣，在血缘上比起乞颜部还要高贵。铁木真此时已经继为蒙古大汗，自然希望在蒙古诸部中唯我独尊，他可以对服从自己的人异常宽容，但对于挑战自己权威和尊严的人，却绝对要残酷打压。

　　铁木真认为，绝不能给予别人轻易践踏自己权威的机会，不然他们就会得寸进尺。虽然铁木真还需要仰仗贵族的支持，但归根结底贵族们还是臣属，所以铁木真必须强硬起来。他让不里孛阔、豁里真合屯和忽兀儿臣合屯跪在自己面前，让他们承认错误。然而，这几个人态度非常蛮横，对于铁木真的审问一脸鄙夷。铁木真大怒，命人用鞭子抽打他们，不里孛阔却大骂：“你居然敢打主儿勤氏人，你忘记了你是怎样成为大汗的吗？你这个忘恩负义的白眼狼。”

　　铁木真将他们关了起来，这件事情突显了铁木真与旧贵族之间真正的厉害矛盾，贵族只将铁木真当成牌位摆设，并没有把他看做真正的权威。在贵族们看来，性格温和的铁木真容易控制，却忽略了他内心深处对于权利的强烈渴求。表面上铁木真处理的是违反规矩的主儿勤奴才，实际上却是他与贵族势力之间针对权利的角逐。铁木真希望得到大汗应有的尊重，但贵族们却不想让他专揽权威，于是开始联合起来掣肘。主儿勤部并没有派人来道歉，倒是其他三大贵族纷纷前来求情，这让铁木真非常烦恼。