先遣队于4月24日抵达加里曼丹岛附近水域。
　　4月22日，三十名特种兵队员先换乘潜艇到达距岛约三海里处，最后游上岸，进行侦察，查明了岛上守军的兵力、装备、火力配置，并为后续部队的登陆选择了机降地点。
　　4月25日，岛上的特种兵引导第3海军陆战旅第1营机降在岛上，这样部队就在陆上首先抢占到了重要的前进基地，这样就可以从容的将人员和各种装备输送上岛同时将部队展开。
　　南华联邦共和国外交部宣布从1960年4月30日十一时起，所有进入加里曼丹岛周围200海里禁区的飞机和舰只都将遭到攻击。
　　印尼和马来西亚军队也进入最高戒备状态，在加里曼丹岛开始实行灯火管制和宵禁。
　　1960年5月1日，南华共和国军队开始对加里曼丹岛守军进行攻击。

　　从布鲁岛起飞的重型轰炸机和从航母起飞的战斗机首次空袭加里曼丹岛。
　　以后，空军不断对加里曼丹岛进行轰炸，主要目标是机场、雷达站、仓库等。
　　这大大打击了守军的士气，并使得印尼和马来西亚海军主力撤离加里曼丹岛海域，不敢出战。
　　印尼空军在5月4日派出一架法制神秘式战斗轰炸机在加里曼丹岛以东40海里处发射了两枚法制空对舰导弹，击沉南华联邦共和国驱逐舰－－巴松号，舰员亡20人，伤27人。
　　这对登陆部队的打击极大，此后登陆部队吸取教训，采取各种措施防范导弹攻击，最典型的办法就是派出加装了预警雷达的直升机在舰队上空进行早期警戒。
　　南华军队为了免受对方航空兵的威胁于5月6日派遣十六名特战队员先搭乘潜艇再换乘橡皮舟潜入爪哇岛的里奥－加列戈斯空军基地，一举炸毁印尼军仅有的14架神秘式战斗轰炸机中的10架，使印尼军的远程打击能力受到重创。
　　印尼空军让南华军队的恶梦久久不能结束。
　　5月12日，印尼航空兵又在文莱附近水域重创航母编队护卫舰两艘，这些飞机都是由爪哇岛印尼军用机场起飞的。
　　为了拔掉肉中刺，五十名特种兵在5月14日晚乘三架直升机机降于岛上，炸毁印尼军6架普卡拉式攻击机，4架t－34教练攻击机，1架运输机。
　　队员中的炮兵观察组指引攻击机猛轰岛上的目标，岛上的1座军火库，6座雷达站均被炸毁。
　　特种兵在烈火中乘直升机安然返回，以轻伤2人的代价取得全胜，扫清了空中的障碍。
　　由于加里曼丹岛上的华籍居民很多，所以南华联邦共和国特工人员可以在他们的掩护下，一面摸清守军的布防，一面积极活动，四处袭扰，唯独对守军的指挥部没有袭击。
　　主要原因就在于已经破译了印尼和马来联军的密码，守军的指挥部成了情报来源的重要途径。
　　到6月10日，南华部队基本上达到了封锁加里曼丹岛、削弱岛上守军力量的目的，并已作好了在登陆的准备工作。

　　随即，确定于6月10日登陆。
　　第2天，印尼军又出动近百架次飞机，继续发动猛烈空袭，击沉了南华海军的唐山号护卫舰。
　　6月15日，印尼和马来西亚空军倾全力出击，全天出动约200多架次，取得击沉滦南号驱逐舰，击沉2艘运输舰，击伤1艘驱逐舰，1艘护卫舰，3艘运输舰的辉煌战绩。
　　对登陆部队而言，不幸中的大幸是运输舰上运送的16架多用途直升机在被击沉前就飞到了岸上。

　　一个星期以来，印尼和马来西亚空军英勇战斗，给予南华登陆部队沉重打击。
　　但一来飞机性能不及南华空军，二来又得不到自己海陆军的有力支援，三来由于战备较差，低空攻击投下的丨炸丨弹因为丨炸丨弹的起爆条件都设在由高空投掷，因此有40%的丨炸丨弹没有爆炸，所以无法阻止登陆。
　　印尼和马来西亚空军在6月15日损失飞机高达61架。
　　马来西亚驻东马部队于24日、25日也派出小股兵力对文莱地区联合军进行侦察袭扰活动，但被击退。
　　由于守军地面部队未进行反登陆作战，而航空兵反击的又主要打击舰船，这样使使南华部队顺利地登陆和巩固了登陆场，并完成了陆上进攻准备。
　　站稳脚根的登陆部队在6月27日开始向守军发起攻击。
　　自南华军队开始陆上进攻以来，印尼和马来西亚多次出动航空兵袭击联合军舰船和补给基地。

　　6月30日，印尼空军使用法制导弹攻击索龙号航母，以2架飞机被击落的代价击伤索龙号。
　　7月8日，印尼军出动大批飞机空袭在滩头的联合军，击沉小型登陆舰1艘，击伤护卫舰1艘，巡逻舰1艘。
　　印尼军损失飞机61架，但此时的印尼空军已如强弩之末再也无力阻止联合军的进攻。
　　此时，南华部队在岛上的力量已大大增强，共有地面部队三个装甲旅，一个海军陆战队旅，重炮450门，各型坦克920辆。
　　7月11日，经三天的准备，南华空军重型轰炸机和攻击机以及牵引火炮进行密集攻击进行火力掩护，支援地面部队向守军的核心防线猛攻。
　　7月18日，岛上的守军主力印尼第7军在3个小时的战斗中被南华共和国第2，3装甲旅全歼。

　　这次战争中南华部队亡1000余人，伤3300人左右，失踪数百人，损失舰船11艘，飞机27架。
　　印尼和马来西亚军亡25500人，伤37770人，被俘51000余人，损失舰船36艘，飞机234架。
　　19世纪初以来，在加里曼丹岛上曾有私人对金矿、钻石、锑、镁、石膏和铁矿等进行过小规模开采。
　　岛上的汶莱丹戎巴里把板及婆罗洲北岸大陆棚等地区有十多处地点有油田，东海岸开发集中於阿塔卡地区。
　　1958年以来，位于西南地区的达图角已开发铝土矿，西南部有煤矿开采。
　　一般而言，除少数肥沃的火山地区以外，加里曼丹岛土地贫瘠。
　　居民主要食物为稻米，另有玉米、木薯、黄瓜、南瓜、原住民小规模种植橡胶，华人居民大规模种植胡椒。
　　近来，婆罗双属树种及糖胶树胶在市场上受到欢迎。
　　沿海地区出口大米、椰子干、卡奇染料，是自红树皮提取及水产。
　　高地种植烟叶，运销低地地区。

　　试种咖啡、可可和大麻，效果都很好。
　　沉香好不好与它的产地是密切相关的，而印尼的加里曼丹就是其中重要的一个产地，因其独特的地理位置造就了远近闻名的沉香，加里曼丹原产的野生沉香是沉香中的上品。
　　几百年以前不少广东人前往南洋谋生，由于广东人擅长经商，因此，不少从事贸易的人都很受当地酋长的敬重。
　　当时由于不少欧洲人前往当地骚扰，所以当地有华人社团从广东省招请团练，来到南洋担当类似保镖的角色，当中势力最大的是南方公司。
　　后来，不少酋长都要求南方公司保护他们，所以南方公司当时的老板罗芳伯就在当地成立共和国，并担任国家的大总，总揽国家的保安及各部族之间的协调工作。
　　而各部族的内部事务，仍然由酋长负责。

　　此外，由于罗芳伯得知洋人对清朝仍然非常顾忌，所以在立国之初就立即向清朝称臣，并派员前往北京朝贡。